2020 年 7 月 1 日、《國安法》生效翌日，多區有人上街示威。案發時年僅 17 歲的青年被指損毀港鐵天后站的設施，並在北角英皇道試圖點燃紙箱，一年後涉販運可卡因。他早前承認企圖縱火、販毒等 4 罪，還押至周五（10 日）在西九龍裁判法院（暫代區院）判刑。 法官王詩麗判刑時指，被告行為無知、愚昧及自私，伙同另一人破壞港鐵設施後未有罷手，反而走出英皇道試圖點燃紙箱，一而再、再而三犯案。法官又指，被告身穿黑衣、攜雨傘到場，「目的昭然若揭」，最終連同販毒罪，合共判囚 49 個月。
41 歲男子被指 2022 年 2 月，感染新冠病毒期間，前往「美心 MX」、「吉野家」等餐廳，又疑在 Facebook 群組「香港黃色經濟圈」發布吉野家食物照片稱「明嘅就明」、「林鄭你要攬炒，我實去多啲藍店」。他被控 12 項「使其他人蒙受感染的風險」罪，裁判官李志豪周一（30 日）裁定被告表證成立。被告周二（31 日）在西九龍裁判法院選擇出庭作供。 被告認為他當時僅快測陽性，但政府尚未承認快測結果，認為只有「一半一半」機會確診，而且沒有收到隔離令，相信外出並不犯法。他又強調，只是因為生活所需才外出。但控方引述被告向警方錄取的口供，他當時表示「不滿政府防疫措施，導致我失業，一時意氣用事」而發文。控方質疑被告當時到訪不同地方，目的為使人蒙受感染風險，被告否認。案件押後至 3 月 8 日裁決。
41 歲男子被指 2022 年 2 月感染新冠病毒期間，前往「美心 MX」、「吉野家」等餐廳，又疑在 Facebook 群組「香港黃色經濟圈」發布吉野家食物照片稱「明嘅就明」、「林鄭你要攬炒，我實去多啲藍店」，又另外上傳快測陽性的照片。 他被控 12 項「使其他人蒙受感染的風險」罪，周一（30 日）在西九龍裁判法院開審。裁判官李志豪裁定被告表證成立，被告選擇出庭作供，透露將爭議政府案發時不承認快測結果。案件周二（31 日）續審。
2022 年 7 月，六旬許姓男子偕妻乘搭港鐵屯馬線，赴元朗探望朋友時，中途在紅磡站下車去洗手間，其後失聯。其子稱曾致電港鐵職員代為尋人，但對方指沒尋獲。該站清潔女工事隔 6 小時後，發現殘廁反鎖，開門後揭許翁倒臥廁所內，送院後證實不治。許翁的妻子周五（20 日）入稟區域法院，向港鐵公司提出傷亡訴訟，要求港鐵賠償，但沒註明金額。
2020 年 7 月 1 日《國安法》生效翌日，多區有人示威。兩名 18 歲青年被指在港鐵天后站破壞燈管等設施，並在英皇道企圖以火機點燃紙箱，其中一人周四（19 日）在區域法院承認刑事損壞及企圖縱火等 3 罪，並就另一宗販毒案認罪，還押至 2 月 10 日判刑。 辯方求情指，被告一時衝動，沒有帶犯案工具到場，「有心打爛（嘢）唔會淨係帶雨傘」。法官王詩麗反問「打鏡頭唔需要長矛、鐵棍呀？」她又認為，被告一身黑衣、攜有雨傘，質疑意圖明顯，「遮可以有好多功用，遮住人哋、（等人）辨認唔到，你使用佢就係一種武器嚟㗎喎」。
2021 年 8 月 30 日近凌晨時分，1 名違規使用長者八達通的男乘客於港鐵柴灣站 E 出口附近，與檢查車票的港鐵職員爭執，職員即場報警。該男子涉沒有遵從告示等，違反《香港鐵路附例》，暫委裁判官郭子丰周一（16 日）於東區裁判法院裁定其罪名不成立。
裁判官裁決時指，作供的港鐵職員有誇大之嫌，或有時顯得含糊閃爍，無法回答準確的時間、距離等，認為其供詞「不可靠」、「不可信」，相反被告於爭執期間表現冷靜理智，也有即場繳付違規使用長者卡的 500 元罰款，以及配合警方、出示自己的身份證，認為控方不能在毫無合理疑點下推論被告有罪。
2019 年 11 月 12 日，反修例示威者發起「破曉行動」，多區有人堵路，發動「三罷」。其中 4 名男學生被指從粉嶺一條行人天橋，將鐵枝等物品投擲到火車路軌上，事隔逾兩年被起訴，裁判官陳炳宙周四（22 日）在粉嶺裁判法院就特別事項裁定，不接納所有被告的招認口供。 裁判官陳炳宙表示，對警員的部分證供可信性有「極大保留」，指警員在拘捕後未有即時施行警誡，令被告在不知其有緘默權下作出招認。裁判官另質疑警員故意違反查問疑犯守則，明知其中 1 名被告案發時未滿 16 歲，但仍在其家長不在場下打算補錄口供，認為若依賴警員證供作裁決是危險和不穩妥。 裁判官指，控方餘下案情薄弱，不排除 4 人當時出於好奇，向下望向路軌，因此裁定 4 人表證不成立，毋須答辯下獲當庭釋放。
2018 年，港鐵沙中綫工程爆出剪短鋼筋、擅改圖則等問題，令工程一再延誤，至 2022 年中才正式通車。屋宇署事後票控紅磡站承建商禮頓建築違反《建築物條例》，控罪涉及一個機房工程。案件周二（13 日）在九龍城裁判法院作審前覆核。 控方指，預計需 15 天審訊，據悉控方證人包括港鐵工程師等，辯方則指將傳召專家及事實證人。暫委裁判官沈智輝關注審訊日子過長，或需排期至 2024 年開審，要求控辯雙方進一步商討同意案情，押後至 2023 年 2 月 23 日再作審前覆核。
一名七旬男中醫，被指去年在港鐵車廂內，尾隨並 4 度觸摸 15 歲女學生大腿，周二（11 日）在西九龍裁判法院，被判非禮罪名成立。 裁判官施祖堯批評被告證供自相矛盾，辯稱因擔心疫情，乘港鐵沒有捉着扶手，但裁判官認為，若被告真的關注疫情，「撞到陌生人構成衞生風險豈非更高」，又質疑被告「由上而下掃」事主，與失平衡「拉不上關係」，裁定被告觸摸 X 時具猥䙝意圖。 辯方求情時透露，被告有一項同類定罪紀錄，但指被告年長，重犯機會低。裁判官下令被告還押至 10 月 25 日判刑。
2020 年 7 月 1 日《國安法》生效翌日，多區有人示威反對。兩名 18 歲青年被指在北角企圖縱火損毀港鐵財產，被控企圖縱火、刑事損壞連交替控罪共 7 罪。其中次被告的案件周二（23 日）在區域法院提訊。辯方透露首被告擬認罪，次被告則擬否認控罪。 法官高勁修押後案件至 2023 年 5 月 22 日開審，進行 4 天中文審訊，期間次被告續准保釋，並批准他更改到警署報到的時間。