政府周一（8 日）向立法會提交文件，建議訂立國安附屬法例，由特首發證明書定性刑事案是否涉國安，須列為國安案處理。政府周二（9 日）下午發稿，指特首會同行政會議已通過建議，有關附屬法例同日刊憲並即時生效。
根據刊憲條文，特首一旦就某刑事案件發出證明書，該案即屬國安案件，並適用於《國安法》生效前的案件。證明書發出後，「任何人不得在任何法院對上述證明書提出質疑」。
政府擬訂國安附屬法例，就「其他國安罪行」設定義機制，由特首定性刑事案涉國安，須列為國安案處理。特首李家超周二（9日）在行會前見記者，被問及會否擔心公眾有一人「話晒事」、權力集中在特首的觀感。
李家超表示，特首發證明書是非常嚴謹、嚴肅的行為，又指特首可閱讀敏感、國家層面的情報，而且危害國安的圖謀大多涉及「國家級嘅高手」，適宜由特首行使權力，重申修例旨在令法例更加清晰，沒有擴充罪行定義，亦無增加罰則和權力。
另外，政府周一（8日）深夜回覆《法庭線》查詢，指若特首發出證明書，必然會告知法庭和被告，又指國安案審訊一般公開，公眾「便有機會」從中知道特首有否發證明書。
政府建議根據《維護國家安全條例》（俗稱「23條」）訂立附屬法例，訂明若特首發出證明書認定某些刑事罪行涉及危害國安，該案即屬國安案件，以國安相關程序處理；同案所涉及的交替控罪，亦會被視為國安罪行。
律政司司長林定國強調，附屬法例只是更清楚界定現有機制，沒新增任何罪行、罰則或執法權力，而特首發出證明書後，法院無權推翻。保安局局長鄧炳強則指，有關修訂不會「加辣」，當特首發出證明書後，案件將由指定法官審理、可延長扣留期等。
翻查資料，「港大評議會案」被告張敬生在 2024 年申請人身保護令時，曾爭議所承認的交替控罪非國安罪行，要求獲獄中行為良好扣減提早獲釋。特首其後發證明書指案件涉國安，國安委亦介入指其交替控罪屬國安罪行，最終申請失敗。