2019 年 12 月 8 日「國際人權日大遊行」前夕，警方於全港多處檢獲槍械等違禁物品，拘捕 13 人，當中 10 人被政府首引《聯合國（反恐怖主義措施）條例》下的「對訂明標的的爆炸的禁制罪」起訴。其中一名 24 歲男子，與另一名同歲女子，另被控一項「串謀提供或籌集財產以作出恐怖主義行為」罪，案件周一（ 28 日）在東區裁判法院進行第 2 次提訊日，裁判官何慧嫻正式將本案轉介至高等法院審理，日期待定，期間首被告須續押，次被告則獲續保。 已還押約 44 個月的首被告，應訊時數度抿嘴和咧嘴微笑，又不時望向旁聽席，以口型與親友隔空傳話。
10 人被指於 2019 年串謀殺害警察，被控《反恐條例》「對訂明標的的爆炸的禁制罪」及「串謀謀殺」等罪。10 人當中，其中一名 24 歲男子，被指與另一名女子干犯「串謀提供或籌集財產以作出恐怖主義行為」罪，案件周四（20 日）在東區裁判法院提訊。 裁判官陳志輝押後至 8 月 28 日再作提訊日，以繼續處理交付至高院之程序。傳媒因報道限制，不可報道程序內容。男被告須繼續還押，女被告則獲准續保。翻查資料，男被告自 2019 年 12 月被捕，至今已還押 43 個月。
2020 年初，深圳灣口岸公廁、羅湖港鐵車廂等被發現有爆炸品，事後有組織承認行動，指為要求政府「封關」。警方其後拘捕及起訴 8 人，其中一名被起訴時 23 歲的女大學生周一（10 日）於高等法院申請保釋。法官李素蘭聽畢雙方陳詞後，拒絕被告保釋申請，被告須繼續還押。 被告何培欣（23 歲）於2022 年 2 月首度提堂，還押至今近一年半。她曾在還押約 3 個月時向高院申請保釋被拒，周一（10 日）再向高院申保釋被拒。
2019 年 12 月 8 日「國際人權日大遊行」前夕，警方於全港多處檢獲槍械等違禁物品，拘捕 13 人，當中 10 人被政府首引《反恐條例》下的「對訂明標的的爆炸的禁制罪」起訴，罪成最高可判囚終身；案件將於 2024 年 2 月 19 日在高院開審，料審 60 日。 被控該罪、已還押逾 42 個月的 24 歲男子，與另一女子被控一項「串謀提供或籌集財產以作出恐怖主義行為」罪，案件周四（15 日）在東區裁判法院進行提訊日。裁判官梁少玲將案押至 7 月 13 日再提訊，男被告還押看管，女被告續准保釋，並獲准更改條件。
壹傳媒創辦人黎智英被控「串謀勾結外國勢力」，2022 年 10 月獲高等法院批准，聘用英國御用大狀 Tim Owen 來港抗辯。律政司不服提上訴，先後被上訴庭、終審法院駁回。全國人大常委會其後應港府提請，就《國安法》第 14 及 47 條釋法，指在危害國安案件批准聘任海外律師前，應先取得特首發出的證明書，案件押至 2023 年 9 月開審。
黎智英分別於 3 月及 4 月入稟高院及提司法覆核，要求律政司宣布人大釋法不會影響法院早前批准 Tim Owen 來港為其抗辯的決定，又指國安委建議入境處拒絕向他批出簽證，僭越《國安法》權力，高院周五（28 日）處理兩宗申請。
律政司一方指，香港法院無權干預國安委的決定。黎一方則認為，國安委角色如「補底」，不包括建議入境處拒絕向 Tim Owen 批出簽證，法庭有權及責任介入。他質疑若國安委的決定不能被挑戰，變相權力比行政長官更大，舉例指可以囚禁市民至死、充公資產，法庭仍無法介入，「恐怕要跟法治重大的一部分說再見」。法官聽畢雙方陳詞，表示押後裁決，並於一個月內頒下判詞。
2020 年初，深圳灣口岸公廁、羅湖港鐵車廂等被發現有爆炸品，事後有組織承認行動，指為要求政府「封關」。警方其後拘捕 8 人，其中一名男被告周二（28 日）於高等法院申請保釋，獲法官張慧玲批准。法官批准被告保釋後，對他表示「你真係唔好令我失望」。
2019 年 12 月 8 日「國際人權日大遊行」前夕，警方搜出大批武器，包括手槍、子彈等，拘捕 13 人包括「12 港人」案被告張俊富、張銘裕及嚴文謙。當中 10 人被律政司首引《聯合國（反恐怖主義措施）條例》下的「對訂明標的的爆炸的禁制」罪起訴。另外 2020 年初，深圳灣口岸公廁等被發現有爆炸品，警方事後拘捕 8 人，當中 7 人亦被控以《反恐條例》。 司法機構網頁顯示，前案將於 2024 年 2 月 19 日在高等法院開審，審期預料 60 日。後案則於同年 8 月 1 日開審，審期預料 75 日。據《反恐條例》，相關控罪若罪成，最高可判囚終身。兩案部分被告至開審時，還押時間將達至逾 4 年。
2020 年 8 月，12 名港人涉嫌潛逃到台灣，途中被廣東海警截獲拘留，當中 10 人在內地被控組織他人偷越邊境罪等罪，被判囚 7 個月至 3 年。事發至今近兩年半，李宇軒等 11 人已先後被移交香港；而被判囚 3 年的鄧棨然則仍在內地服刑，在廣州從化監獄度過今個農曆新年，預料他約於今年 8 月刑滿。 12 人在香港分別面對國安、縱火、暴動，以及襲警等罪（見內文表），當中李宇軒、張俊富、張銘裕及嚴文謙面對的控罪最嚴重，罪成最高可判囚終身。已移交香港的 11 人之中，李宇軒等 7 人已認罪；李正還押候判，其餘 6 人已判刑。 至於餘下 4 人，張俊富、張銘裕及嚴文謙 3 人的案件已交付至高等法院，待排期審理。喬映瑜面對製造及管有爆炸品等控罪，案件尚未答辯。此外，除李宇軒及未回港的鄧棨然外，其餘 10 人因潛逃事件，被控妨礙司法公正罪，當中 8 人認罪。
組織「光城者」7 名成員被指擺街站提倡以武力推翻政權，7 人早前承認「串謀煽動顛覆政權」罪，其中 5 名未滿 21 歲被告，周六（8 日）在區域法院被判入教導所。本案屬首宗有未成人因《國安法》定罪的案件，同案另外兩名成年被告押後至 11 月 25 日再訊。
《國安法》指定法官郭偉健判刑時指，本案整體上屬「情節嚴重」，被告對香港及國家有嚴重錯誤的觀感，產生「流血革命」的極端思想，又試圖說服他人無底線抗爭，即使只有一小撮人、甚至一人被煽動，亦會對社會治安構成風險。
但法官指，5 名被告案發時年輕、不成熟、或受誤導，犯罪情節降低為「情節較輕」。考慮到公眾利益仍須判處阻嚇性刑罰，社會服務令並不足夠，在平衡阻嚇性及更生後判 5 人入教導所。
